Configurando o AutoMySQLBackup em MySQL 5.6 voltou a mensagem de erro warning using a password on the command line interface can be insecure, para resolve apliquei o ajuste depois da linha 115

# Remove annoying warning message since MySQL 5.6
 if -s "$log_errfile" ; then
 sedtmpfile="/tmp/$(basename $0).$$.tmp"
 grep -v "Warning: Using a password on the command line interface can be insecure." "$log_errfile" > $sedtmpfile
 mv $sedtmpfile $log_errfile
 fi

dica retirada do site redeo.nl